L'Albero Deku, o Grande Albero Deku, è un enorme albero che appare in Ocarina of Time ed in The Wind Waker. Fa inoltre un cameo in Hyrule Warriors.
Ocarina of Time[]
In questo gioco, l'Albero Deku prende sotto la sua protezione Link, e inoltre incarica Navi di diventare la fata personale del ragazzo. Link viene convocato al suo cospetto, essendo a conoscenza del fatto che Link dovrà salvare Hyrule, e gli racconta della maledizione lanciata da Ganondorf che lo ha colpito. Quindi Link si avventura all'interno dell'albero, verso il primo dungeon del gioco: l'Interno dell'Albero Deku, dove l'eroe potrà ottenere la Fionda. Sebbene Link riesca a sconfiggere Ghoma, l'Albero Deku muore. Successivamente, però, dall'Albero Deku nasce un nuovo Germoglio, il quale racconta a Link la sua vera origine.
Wind Waker[]
In questo gioco, il Germoglio dell'Albero Deku, giunto nell'Arcipelago dei Boschi, è ormai cresciuto. Link, quando giunge nella sua nuova dimora, lo troverà purtroppo infestato dai dei ChuChu, e quindi il nuovo eroe dovrà sconfiggerli. Esso fornirà la Foglia Deku.
Hyrule Warriors[]
In questo gioco fa un piccolo cameo nella Foresta di Firone, dove costituisce il presidio omonimo. Inoltre, però, il Germoglio appare durante gli attacchi della Lancia Deku, arma di Lana.