La Fontaine des Licornes est un élément majeur qui a été supprimé de la version final d'Ocarina of Time.
On ne sait pas grand-chose sur cette salle, si ce n’est qu’elle permettait d’apprendre une nouvelle attaque à l’épée. L’attaque a fini par être retirée du jeu car elle n’était apparemment pas nécessaire, et ainsi, la Fontaine de la Licorne, devenue inutile, a également été abandonnée. Les moyens d'accès dans le jeu à cette fontaine demeurent inconnus. Des théories veulent que cette fontaine ait été accessible à partir d'un passage situé sous l'eau au domaine Zora (on peut prendre ce passage grâce à des glitchs, voir plus bas), mais rien n'a été confirmé.