- Uno de los agujeros ocultos de The Legend of Zelda: Twilight Princess no fue editado para la versión de Wii, por lo que al recoger larvas de abeja, la caja de texto indica al jugador que las asigne a Y o X, botones pertenecientes al mando de Nintendo GameCube.
- En The Legend of Zelda: Oracle of Ages, hay un momento que recrea el juego arcade Donkey Kong de 1981. Este es cuando Vire secuestra a la Princesa Zelda en la Torre Negra y Link acude a su rescate. De este modo, Vire representaría a Donkey Kong; Zelda, a Pauline; y Link, a Jumpman.
- En el trofeo del Tren Diabólico para Super Smash Bros. (3DS), se especifica que a pesar de que su rostro se parece al de Ganondorf, no existe ninguna relación entre ellos.
- En The Legend of Zelda: Tri Force Heroes, existe un aspirante a Héroe Totémico que tiene el mismo aspecto que el sprite de Link en The Legend of Zelda: A Link to the Past, aunque adaptado al estilo gráfico de este juego y siendo su rasgo más notable su pelo rosa. Sin embargo, difiere en que este personaje no tiene las orejas puntiagudas típicas de los Hylianos.
- En The Legend of Zelda: Ocarina of Time, cuando Link entra en la sala donde se enfrenta a Link Oscuro, en un principio se ve su silueta reflejada en el agua. Sin embargo, después de llegar al fondo de la habitación, su reflejo deja de ser visible y es cuando Link Oscuro aparece.
- En la versión de Zelda II: The Adventure of Link para la Family Computer, los diseños de los ladrillos de los palacios son o de color gris o uno de color azul. Sin embargo, en el juego para Nintendo Entertainment System, cada uno de los palacios cuenta con un color específico y único.
- Durante el primer ciclo de tres días de The Legend of Zelda: Majora's Mask, el tiempo interno del juego transcurre un 66% más rápido de lo normal.
- En The Legend of Zelda: Spirit Tracks, debido a una mala traducción del juego al español, en un momento dado Bigboy se refiere a Nico como al abuelo de Link. Este error se debió a que en Aldea Nostra, la gente se suele referir a él cariñosamente como el "abuelo Nico".
- Durante una entrevista, Eiji Aonuma comentó que el hecho de que la línea de máscaras con forma de animal de The Legend of Zelda: Majora's Mask coincida con cinco de los personajes de la saga Star Fox fue pura casualidad; o al menos que a él no se le informó de ello.
- En la barandilla de la base de la escalera de madera que lleva a la Efigie de la Diosa de The Legend of Zelda: Skyward Sword, se puede ver el número 25, que hace referencia al 25º aniversario de la academia de caballeros (y por consiguiente a los 25 años que cumplía la saga The Legend of Zelda con ese juego).
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