El Curso Alto del Río Zora (Upper Zora's River en inglés) como su nombre indica, es la zona más elevada del curso del Río Zora durante The Legend of Zelda: Twilight Princess. Es la zona del río más cercana al Dominio de los Zora, es decir, su nacimiento. En ella suceden varios eventos de la historia, además de que se encuentran dos minijuegos: el Muelle de Pesca y los Rápidos del Río Zora.
La primera vez que Link llega a esta parte del río, lo hace como lobo, pues la región está inmersa en el crepúsculo. Al llegar Link debe luchar con varios Seres de las Sombras, que tras derrotarlos dejarán un portal del crepúsculo. Después de que Link disipe el crepúsculo sobre la región, Flora, la responsable de la tienda de alquiler de canoas, quedará impresionada por la valentía del joven y le dejará entrar en su cabaña. Ella le pide que le ayude despejar el camino río abajo, pues el curso del río está bloqueado por un desprendimiento de rocas. Si Link acepta, Flora le prestará una canoa para que pueda cursar el río y una bolsa de bombas, que al combinar con flechas se obtienen las flechas bomba. Con estos objetos, el joven héroe procede a despejar el camino del río. En la misión Link no está solo, pues una Zora que trabaja como asistente de Flora le acompaña. Una vez que Link cumple el trabajo y alcanza el final del trayecto, es decir el Lago Hylia, la Zora le permite quedarse con la bolsa de bombas que Flora le había prestado. Con la misión cumplida, si Link vuelve a la cabaña de Flora podrá jugar al minijuego Rápidos del Río Zora.
Además, la zona también cuenta con una de las Piedras del Aullido. Y por si fuera poco, la hermana de Flora, Rosita, también reside en el Curso Alto del Río Zora, donde administra el Muelle de Pesca. Link puede ir al muelle para pescar, ya sea lanzando su caña desde la orilla o alquilando una canoa a Rosita para ir a pescar por todo el lago del que dispone el muelle. Rosita también le da a Link la oportunidad de probar sus habilidades en otro juego llamado Rueda-Rueda, que se inventó ella misma.